К характерным чертам рельефа пустынь надо отнести сухие русла и бессточные впадины, в том числе весьма крупные. Одни из них, котловинообразные по форме(Сарыкамыш, Барсакельмес и др.). Самая глубокая впадина — Карагие (—132 м ниже уровня океана) — находится на территории Западного Казахстана; другие впадины линейные: Унгуз, Западный и Келифский Узбой и ряд мелких. Унгуз протянулся в широтном направлении от Амударьи до колодцев Екедже и Додур почти на 400 км; ширина его 15—20 км.
Разделяя Заунгузье и Низменные Каракумы, Унгуз состоит из ряда отдельных впадин, перегороженных перемычками. На дне небольших впадин находятся шоры и такыры, в восточной части — пески. Одно время Унгуз считали рукавом Амударьи, свидетельством ее блужданий. Но исследования советских географов показали, что возникновение Унгуза обязано, вероятнее всего, тектоническим процессам с последующим влиянием карстово-суффозионных явлений.
Келифский Узбой тоже представляет собой линейно вытянутую цепочку впадин в Юго-Восточных Каракумах. Но в отличие от Унгуза эти впадины носят ясные следы влияния Пра-Амударьи, находясь на одном из путей ее блужданий по Каракумам. Впадины менее глубокие разделены невысокими перемычками, притом не из коренных пород, как Унгуз, а песчаными. Часть впадин Келифского Узбоя затоплена водами Каракумского канала, так как трасса прошла по понижению, занятому Келифским Узбоем.
Из сухих русл самое крупное — Западный Узбой. Он ясно прослеживается от южного берега Сарыкамыша до солончака Келькор и по сухому руслу Актам доходит до Каспийского моря. Общее протяжение Западного Узбоя — 500 км, максимальная ширина долины — 3 км, самая большая глубина — 40 м. В его русле находятся соленые озера, а в южной части и несколько пресных, а также шоры и соленые грязи. Узбой служит стоком излишних вод из Сарыкамыша. По одним данным, пресная вода в нем была в доисторическое время (Кесь, 1936). Утверждалось также, что сток воды был и в средние века (Ямнов и Кунин, 1953). Отдельные прорывы вод из Сарыкамыша были и в XIX в. (Берг, 1934).